Основные структурные единицы:

• Институт американистики и польской диаспоры (страница на английском языке),
   
• Институт Ближнего и Дальнего Востока (страница только на польском языке),
   
• Институт европеистики (страница на английском языке),
   
• Институт политических наук и международных отношений (страница на английском языке),
   
• Институт России и Восточной Европы (страница только на польском языке),
   
• Институт межкультурных исследований (страница на английском языке),
   
• Кафедра украиноведения (страница на английском языке),
   
• Центр по изучению Холокоста (страница только на польском языке),
   
• Центр китайского языка и культуры „Институт Конфуция" (страница на английском языке),
   
• Центр литовских исследований (страница только на польском языке).


• Институт имени Короля Сечжона

Межфакультетные подразделения:

• Центр количественных исследований в области политики (страница на английском языке),
   
• Центр миграционных исследований Ягеллонского университета (страница только на польском языке).

Остальные подразделения:

• Польский научный центр Ягеллонского университета в Лондоне (страница на английском языке).